Odbor plní rozhodující úkoly ve smyslu příslušného vnitrostátního orgánu (NCA) pro oblast ATM/ANS a vnitrostátního dozorového orgánu (NSA) České republiky dle přímo použitelných předpisů EU a v rámci výkonu státní správy, státního dozoru a provádění dalších činností dle zákona o civilním letectví. Při plnění těchto úkolů úzce spolupracuje s manažerem systému řízení, s odborem způsobilosti leteckého personálu SL, auditorem bezpečnosti a s ostatními organizačními útvary sekce provozní.
Odbor se svojí činností podílí v rámci součinnosti s orgány jiných resortů na zajištění svrchovanosti České republiky nad jejím vzdušným prostorem a požadavky státu, které se vztahují k veřejnému pořádku, veřejné bezpečnosti a záležitostem obrany.